Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM47Q96LD4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms