Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT74Q96LB3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms