Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX27Q96L92 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX27Q96L92 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX27Q96L92 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX27Q96L92 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms