Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD4Q96KN9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD4Q96KN9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms