Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC12Q96J65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms