Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN37Q96GY3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN37Q96GY3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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