Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BICD1Q96G01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms