Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP36Q96EU6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms