Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGF29Q96ES7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms