Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSUN4Q96CB9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms