Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG2BQ96BY7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG2BQ96BY7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms