Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDB2Q92466 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms