Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113Q902F9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERVK_113Q902F9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms