Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms