Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RB1CC1Q8TDY2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RB1CC1Q8TDY2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms