Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms