Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms