Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RNF169Q8NCN4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF169Q8NCN4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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