Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms