Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLIP4Q8N3C7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLIP4Q8N3C7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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