Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACE1Q8IYU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms