Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAP2Q8IXW5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAP2Q8IXW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms