Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms