Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS37DQ86XT2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms