Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP54Q7Z3B4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms