Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1Q7L576 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms