Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUFY3Q7L099 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms