Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRINP3Q76B58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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