Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms