Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD6Q6ZV73 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD6Q6ZV73 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms