Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms