Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms