Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1LQ6UX01 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1LQ6UX01 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms