Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms