Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRNP1Q6NT89 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms