Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CARMIL2Q6F5E8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms