Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf135Q5VTT2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms