Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms