Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms