Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms