Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF3Q5SZQ8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms