Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39AQ5SRH9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms