Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms