Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC178Q5BJE1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms