Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms