Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVEP1Q4LDE5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms