Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms