Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWC2Q2TAL6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWC2Q2TAL6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms