Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KNOP1Q1ED39 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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