Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UPP1Q16831 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms